PlantSME Plant secondary metabolism enzyme database
IO

IO

Atlas summary family IO.

Lineage Coverage
Detected in 557 of 789 public species; click a lineage to inspect its species list.
Algae
Bryophytes
Lycophytes/Ferns
Gymnosperms
Basal angiosperms
Monocots
Eudicots
Species Distribution
Triticum aestivum
Triticum turgidum
Papaver setigerum
Lonicera japonica
Related Modules
Alkaloid pathway
Pathway Position Map
Pathways are arranged by literature-curated biosynthetic stages and highlight the current enzyme family; branched pathways are grouped by stage rather than forced into one linear reaction chain.
Curated order
Alkaloid pathway 1721 current-family members Facchini 2001; Hagel & Facchini 2013; Guirimand et al. 2014; Shoji et al. 2024; Ashihara et al. 2008
BIA benzylisoquinoline entry
TYDC_DDC 49 NCS 2188 6OMT_4OMT_SOMT 585 CNMT 1103 CYP80B1 109
BIA downstream branches
CYP719 57 COR 12777 CODM/T6ODM 213
MIA terpenoid and indole precursors
GES 29176 G8O/G8H 1896 8HGO 1497 ISY 4217 IO 1721 7DLGT 55281 7DLH 341 LAMT 943 SLS 426 TDC 33
MIA post-strictosidine branches
STR 16085 SGD 25978 GS 15620 T16H 895 16OMT 111 T3O 29276 NMT 40796
Nicotine, tropane, and purine branches
ODC 1268 ADC 2008 PMT 9370 MPO 6100 PYKS 11713 TRI/TRII 28608 H6H 6749 CYP80F1 15 XMT_MXMT_DXMT 70
Family Gene List
GeneSpeciesProtein ID
melaleuca_alternifolia_scf7180000030630_gene_174 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000030630_gene_174
melaleuca_alternifolia_scf7180000030630_gene_180 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000030630_gene_180
melaleuca_alternifolia_scf7180000036283_gene_81 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000036283_gene_81
melaleuca_alternifolia_scf7180000036283_gene_84 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000036283_gene_84
melaleuca_alternifolia_scf7180000036283_gene_86 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000036283_gene_86
melaleuca_alternifolia_scf7180000036349_gene_119 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000036349_gene_119
melaleuca_alternifolia_scf7180000036352_gene_481 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000036352_gene_481
melaleuca_alternifolia_scf7180000036512_gene_166 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000036512_gene_166
melaleuca_alternifolia_scf7180000036650_gene_98 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000036650_gene_98
melaleuca_alternifolia_scf7180000036850_gene_159 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000036850_gene_159
melaleuca_alternifolia_scf7180000036926_gene_616 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000036926_gene_616
melaleuca_alternifolia_scf7180000037302_gene_87 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000037302_gene_87
melaleuca_alternifolia_scf7180000037303_gene_233 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000037303_gene_233
melaleuca_alternifolia_scf7180000037361_gene_150 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000037361_gene_150
melaleuca_alternifolia_scf7180000037782_gene_45 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000037782_gene_45
melaleuca_alternifolia_scf7180000039075_gene_759 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039075_gene_759
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_18 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_18
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_617 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_617
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_618 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_618
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_619 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_619
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_620 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_620
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_621 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_621
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_622 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_622
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_623 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_623
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_626 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_626
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_627 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_627
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_633 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_633
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_634 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_634
melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_636 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039087_gene_636
melaleuca_alternifolia_scf7180000039141_gene_78 melaleuca_alternifolia melaleuca_alternifolia_scf7180000039141_gene_78