PlantSME Plant secondary metabolism enzyme database
SGD

SGD

Atlas summary family SGD.

Lineage Coverage
Detected in 766 of 789 public species; click a lineage to inspect its species list.
Algae
Bryophytes
Lycophytes/Ferns
Gymnosperms
Basal angiosperms
Monocots
Eudicots
Species Distribution
Hordeum vulgare
Aegilops tauschii
Triticum turgidum
Prunus fruticosa
Related Modules
Alkaloid pathway
Pathway Position Map
Pathways are arranged by literature-curated biosynthetic stages and highlight the current enzyme family; branched pathways are grouped by stage rather than forced into one linear reaction chain.
Curated order
Alkaloid pathway 25978 current-family members Facchini 2001; Hagel & Facchini 2013; Guirimand et al. 2014; Shoji et al. 2024; Ashihara et al. 2008
BIA benzylisoquinoline entry
TYDC_DDC 49 NCS 2188 6OMT_4OMT_SOMT 585 CNMT 1103 CYP80B1 109
BIA downstream branches
CYP719 57 COR 12777 CODM/T6ODM 213
MIA terpenoid and indole precursors
GES 29176 G8O/G8H 1896 8HGO 1497 ISY 4217 IO 1721 7DLGT 55281 7DLH 341 LAMT 943 SLS 426 TDC 33
MIA post-strictosidine branches
STR 16085 SGD 25978 GS 15620 T16H 895 16OMT 111 T3O 29276 NMT 40796
Nicotine, tropane, and purine branches
ODC 1268 ADC 2008 PMT 9370 MPO 6100 PYKS 11713 TRI/TRII 28608 H6H 6749 CYP80F1 15 XMT_MXMT_DXMT 70
Family Gene List
GeneSpeciesProtein ID
acorus_gramineus_AGRA_09024 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_09024
acorus_gramineus_AGRA_09025 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_09025
acorus_gramineus_AGRA_09685 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_09685
acorus_gramineus_AGRA_10752 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_10752
acorus_gramineus_AGRA_11119 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_11119
acorus_gramineus_AGRA_11120 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_11120
acorus_gramineus_AGRA_11121 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_11121
acorus_gramineus_AGRA_11160 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_11160
acorus_gramineus_AGRA_12918 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_12918
acorus_gramineus_AGRA_12947 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_12947
acorus_gramineus_AGRA_14997 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_14997
acorus_gramineus_AGRA_17860 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_17860
acorus_gramineus_AGRA_18635 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_18635
acorus_gramineus_AGRA_19733 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_19733
acorus_gramineus_AGRA_20556 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_20556
acorus_gramineus_AGRA_20567 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_20567
acorus_gramineus_AGRA_21365 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_21365
acorus_gramineus_AGRA_22210 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_22210
acorus_gramineus_AGRA_23133 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_23133
acorus_gramineus_AGRA_23337 acorus_gramineus acorus_gramineus_AGRA_23337
ATA006.37.t1 acorus_tatarinowii ATA006.37.t1
ATA047.94.t1 acorus_tatarinowii ATA047.94.t1
ATA067.8.t1 acorus_tatarinowii ATA067.8.t1
ATA067.9.t1 acorus_tatarinowii ATA067.9.t1
ATA1.1220.t1 acorus_tatarinowii ATA1.1220.t1
ATA1.400.t1 acorus_tatarinowii ATA1.400.t1
ATA1.496.t1 acorus_tatarinowii ATA1.496.t1
ATA10.482.t1 acorus_tatarinowii ATA10.482.t1
ATA10.695.t1 acorus_tatarinowii ATA10.695.t1
ATA10.902.t1 acorus_tatarinowii ATA10.902.t1