PlantSME Plant secondary metabolism enzyme database
CHS

CHS

Chalcone synthase reference family for the core flavonoid pathway.

Lineage Coverage
Detected in 757 of 789 public species; click a lineage to inspect its species list.
Related Modules
Pathway Position Map
Pathways are arranged by literature-curated biosynthetic stages and highlight the current enzyme family; branched pathways are grouped by stage rather than forced into one linear reaction chain.
Curated order
Flavonoid pathway 11738 current-family members Mao et al. 2025; Gulzar et al. 2024; Vogt 2010
Phenylpropanoid entry
Flavonoid scaffold formation
Flavone and isoflavonoid branches
Anthocyanin and proanthocyanidin branches
Family Gene List
GeneSpeciesProtein ID
bretschneidera_sinensis_BsiG0043832.1 bretschneidera_sinensis bretschneidera_sinensis_BsiG0043832.1
bretschneidera_sinensis_BsiG0043853.1 bretschneidera_sinensis bretschneidera_sinensis_BsiG0043853.1
bretschneidera_sinensis_BsiG0044151.1 bretschneidera_sinensis bretschneidera_sinensis_BsiG0044151.1
bretschneidera_sinensis_BsiG0044152.1 bretschneidera_sinensis bretschneidera_sinensis_BsiG0044152.1
bruguiera_cylindrica_evm.model.18890.3 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.18890.3
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_10_RagTag.2 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_10_RagTag.2
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_10_RagTag.293 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_10_RagTag.293
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_10_RagTag.524 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_10_RagTag.524
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_11_RagTag.237 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_11_RagTag.237
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_11_RagTag.238 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_11_RagTag.238
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_11_RagTag.379 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_11_RagTag.379
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_12_RagTag.255 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_12_RagTag.255
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_13_RagTag.721 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_13_RagTag.721
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_14_RagTag.279 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_14_RagTag.279
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_15_RagTag.80 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_15_RagTag.80
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_16_RagTag.247 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_16_RagTag.247
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_17_RagTag.752 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_17_RagTag.752
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_1_RagTag.1792 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_1_RagTag.1792
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_1_RagTag.1851 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_1_RagTag.1851
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_1_RagTag.609 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_1_RagTag.609
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_2_RagTag.168 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_2_RagTag.168
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_3_RagTag.1074 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_3_RagTag.1074
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_3_RagTag.298 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_3_RagTag.298
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_4_RagTag.669 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_4_RagTag.669
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_6_RagTag.491 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_6_RagTag.491
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_6_RagTag.670 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_6_RagTag.670
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_6_RagTag.794 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_6_RagTag.794
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_7_RagTag.167 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_7_RagTag.167
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_7_RagTag.477 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_7_RagTag.477
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_7_RagTag.923 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_7_RagTag.923