PlantSME Plant secondary metabolism enzyme database
CHS

CHS

Chalcone synthase reference family for the core flavonoid pathway.

Lineage Coverage
Detected in 757 of 789 public species; click a lineage to inspect its species list.
Related Modules
Pathway Position Map
Pathways are arranged by literature-curated biosynthetic stages and highlight the current enzyme family; branched pathways are grouped by stage rather than forced into one linear reaction chain.
Curated order
Flavonoid pathway 11738 current-family members Mao et al. 2025; Gulzar et al. 2024; Vogt 2010
Phenylpropanoid entry
Flavonoid scaffold formation
Flavone and isoflavonoid branches
Anthocyanin and proanthocyanidin branches
Family Gene List
GeneSpeciesProtein ID
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_8_RagTag.1202 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_8_RagTag.1202
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_8_RagTag.887 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_8_RagTag.887
bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_9_RagTag.577 bruguiera_cylindrica bruguiera_cylindrica_evm.model.Scaffold_9_RagTag.577
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_1.1782 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_1.1782
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_1.1844 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_1.1844
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_1.646 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_1.646
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_10.2 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_10.2
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_10.529 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_10.529
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_11.1045 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_11.1045
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_11.186 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_11.186
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_11.329 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_11.329
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_12.252 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_12.252
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_13.709 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_13.709
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_14.288 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_14.288
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_15.80 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_15.80
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_16.252 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_16.252
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_16.715 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_16.715
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_17.682 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_17.682
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_2.163 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_2.163
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_276.1 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_276.1
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_277.1 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_277.1
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_3.1098 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_3.1098
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_3.290 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_3.290
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_4.672 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_4.672
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_5.996 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_5.996
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_6.463 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_6.463
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_6.632 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_6.632
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_6.633 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_6.633
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_6.760 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_6.760
bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_7.805 bruguiera_parviflora bruguiera_parviflora_evm.model.Scaffold_7.805